Ο κατά κόσμον Παναγιώτης Βαγενάς γεννήθηκε το 1924 στο Ξυλόκαστρο Κορινθίας. Αποφοίτησε από τη Νομική (1951) και στη συνέχεια (1954) από τη Θεολογική Σχολή του Πανεπιστημίου Αθηνών.

Ευκατάστατος οικονομικά, όταν αποφάσισε να αφιερωθεί και πριν εισέλθει στις τάξεις των κληρικών, την «όχι ευκαταφρόνητη περιουσία του» την μοίρασε σε ιδρύματα και φτωχούς και απολύτως ακτήμων ανέλαβε το έργο του κληρικού.

Διάκονος και Πρεσβύτερος χειροτονήθηκε το 1956.

Υπηρέτησε ως Πρωτοσύγκελος της Μητροπόλεως Τρίκκης και Σταγών.

Στις 26/06/1967 χειροτονήθηκε Μητροπολίτης Κερκύρας και Παξών.

Διετέλεσε τοποτηρητής της Μητροπόλεως Κεφαλληνίας (1982 – 1984).

Εκοιμήθη στις 25/03/1984 στα Φαρακλάτα Κεφαλληνίας κατά την διάρκεια λιτανείας. Η πομπή ξεκίνησε από τον πανηγυρίζοντα ναό, με προεξάρχοντα τον μητροπολίτη Πολύκαρπο, και μετά από κάποιο διάστημα σε προβλεπόμενο σημείο σταμάτησε για την ανάπεμψη της δέησης προς την Παναγία. Και τότε συνέβη ένα μοναδικό, μέσα στην τραγικότητά του γεγονός: ο επίσκοπος έπεσε νεκρός μπροστά στο εικόνισμα και στα έκπληκτα μάτια των παρισταμένων.